Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Npas3Q9QZQ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms