Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms