Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Usp21Q9QZL6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Usp21Q9QZL6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp21Q9QZL6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp21Q9QZL6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp21Q9QZL6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp21Q9QZL6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp21Q9QZL6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp21Q9QZL6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms