Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM8

Cenph, Centromere protein H, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenphQ9QYM8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CenphQ9QYM8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CenphQ9QYM8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms