Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg3Q9QYF9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndrg3Q9QYF9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms