Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcb11Q9QY30 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcb11Q9QY30 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms