Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rai2Q9QVY8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms