Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dkk3Q9QUN9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dkk3Q9QUN9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms