Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr4Q9QUK6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms