Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms