Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crlf1Q9JM58 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Crlf1Q9JM58 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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