Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms