Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb3Q9JKS4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms