Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nova1Q9JKN6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nova1Q9JKN6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nova1Q9JKN6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms