Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
AtrQ9JKK8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
AtrQ9JKK8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms