Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl39Q9JKF7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl39Q9JKF7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms