Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx20Q9JJY4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx20Q9JJY4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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