Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Bco1Q9JJS6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Bco1Q9JJS6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Bco1Q9JJS6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Bco1Q9JJS6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Bco1Q9JJS6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Bco1Q9JJS6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Bco1Q9JJS6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Bco1Q9JJS6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Bco1Q9JJS6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bco1Q9JJS6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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