Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Herpud1Q9JJK5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms