Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Efcc1Q9JJF6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efcc1Q9JJF6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms