Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccl28Q9JIL2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccl28Q9JIL2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccl28Q9JIL2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccl28Q9JIL2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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