Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Praf2Q9JIG8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms