Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r3fQ9JIG4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms