Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pus3Q9JI38 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms