Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc9Q9JHI7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Exosc9Q9JHI7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc9Q9JHI7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms