Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcirg1Q9JHF5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcirg1Q9JHF5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcirg1Q9JHF5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcirg1Q9JHF5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcirg1Q9JHF5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcirg1Q9JHF5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcirg1Q9JHF5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcirg1Q9JHF5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms