Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zcchc17Q9ESX4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc17Q9ESX4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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