Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ropn1Q9ESG2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms