Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp29Q9ES63 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp29Q9ES63 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms