Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube3bQ9ES34 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms