Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chrnb2Q9ERK7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms