Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr61Q9ERF3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr61Q9ERF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms