Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfip11Q9ERA6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfip11Q9ERA6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms