Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dap3Q9ER88 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dap3Q9ER88 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms