Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RhojQ9ER71 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhojQ9ER71 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhojQ9ER71 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhojQ9ER71 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhojQ9ER71 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhojQ9ER71 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhojQ9ER71 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhojQ9ER71 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhojQ9ER71 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms