Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Capn12Q9ER56 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capn12Q9ER56 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms