Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr6Q9EQ16 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cxcr6Q9EQ16 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cxcr6Q9EQ16 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cxcr6Q9EQ16 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr6Q9EQ16 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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