Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r171Q9EPS6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r171Q9EPS6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms