Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms