Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn1Q9EPL2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn1Q9EPL2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms