Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpr88Q9EPB7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpr88Q9EPB7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms