Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med29Q9DB91 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med29Q9DB91 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms