Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med27Q9DB40 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms