Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scp2d1Q9DAH1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scp2d1Q9DAH1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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