Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9DA42 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9DA42 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9DA42 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9DA42 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9DA42 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9DA42 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9DA42 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9DA42 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9DA42 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms