Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms