Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D9S1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D9S1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D9S1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D9S1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D9S1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms