Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn34b2Q9D9N2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms