Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldnd2Q9D9H2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldnd2Q9D9H2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms