Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg7Q9D906 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg7Q9D906 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms